Die Gesamtzahl der Bestände umfasst geschätzte 200.000 Bände. Hierzu einige Zahlen:
- ca. 200 Inkunabeln
- ca. 20.000 Bände von vor 1800 und
- etwa 20.000 Schulprogramme aus den Jahren 1830-1920.
- ca. 10.000 Einheiten von Musikhandschriften und -drucken.

Neben theologischen Werken setzen sich die Bestände auch aus Literatur aller anderen Wissensgebiete zusammen.
-Schwerpunkte sind Geschichte, Philosophie, Philologie.
-Besondere Sammelgebiete sind die Geschichte und Spiritualität der Orden, Benedictina und Bavarica.
-Darüber hinaus besitzt die Bibliothek eine umfangreiche Sammlung an Schuljahresberichten und eine bedeutende Musikaliensammlung.
-In der Bibliothek befinden sich u.a. fünf Fachbibliotheken (Nachlässe) mit den Schwerpunkten Hagiographie, Dogmatik, Epistemologie, Oecumenica, sowie Akten und Schrifttum zum II. Vaticanum.

Ein Großteil der Bestände befindet sich in einem Magazin mit einer Aufstellung nach 65 Fachgruppen. Diese Bestände sind durch einen alphabetischen Zettelkatalog nach RAK erschlossen.
Ein weitere großer Teil befindet sich im provisorischen Bibliotheksgebäude, diese Bestände sind im Online-Katalog verzeichnet und nach RVK systematisch aufgestellt.